Çankırı Karatekin Üniversitesi‘ nin rektörlüğünü Prof. Dr. Ali İbrahim SAVAŞ yapmaktadır. Üniversitede Fen ve Edebiyat Fakültesi, Güzel sanatlar Fakültesi, İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi ve Orman Fakültesi olmak üzere 4 tane fakülte bulunmaktadır.

Çankırı Karatekin Üniversitesine ait bir tane meslek yüksekokulu bulunmaktadır. Bu meslek yüksek okulun adı Çankırı Meslek Yüksekokulu’ dur. Sosyal Bilimler ve Fen Bilimleri Enstitüsü olmak üzere üniversitede 2 adette enstitü bulunmaktadır.